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中国大运河博物馆是一座具有多样功能和多种特性的综合性运河文化中心，位于浙江省杭州市拱墅区运河文化广场1号，地处杭州市北部拱宸桥地区，东起金华路、南至衢州街、西临京杭大运河，北接拱墅区政府，西侧是古老的拱宸桥。总用地面积52910平方米，建筑面积10700平方米，建筑风格总体定位于“传统而不复古”。
中国大运河博物馆以一层为主，局部二层，并有部分地下室。首层主要是博物馆常规展示部分，共四个厅，一条展廊，二层主要是资料室，视听室，办公室，另有半景展厅等。各展厅通过图片、实物、模型等形式，展示和解释大运河丰富的自然人文景观。