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北京蔬菜研究中心是北京市属农业科研机构，也是一所研究设施先进、专业配套齐全、技术力量雄厚、开发实力在行业中名列前茅、综合实力居国内一流水平的蔬菜专业研究机构，主要任务是立足北京，面向全国，瞄准世界蔬菜科技发展的前沿，为中国蔬菜产业的高效可持续发展提供技术支撑，重点研究解决蔬菜产前、前中、产后的关键性的技术问题，进行理论与技术创新，同时进行多学科的综合配套研究与集成，并实现科研成果的产业化，带动我国蔬菜产业的升级。
北京蔬菜研究中心下设蔬菜种质资源与特菜引种研究室、蔬菜生物技术研究室、耐寒类蔬菜育种研究室、茄果类育种研究室、瓜类育种研究室、花卉研究室、蔬菜栽培与设施研究室、蔬菜采后保鲜与加工研究室、蔬菜**与产品质量检测研究室九个研究室；建立了北京蔬菜种质改良实验室、蔬菜活性物质与深加工实验室、资源高效利用实验室和都市园艺与设施实验室四个跨学科综合实验室；下设中心试验农场、四季青试验农场、延庆原种繁育农场及海南试验农场四个实验农场。此外，还有以“中心”为依托的农业部蔬菜**质量监督检验测试中心。