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农科院高山所位于风景秀丽的云南省丽江市古城区黑龙潭旁，主要立足滇西北，面向全省高寒地区，以高山药用植物、高山花卉、经济林果、食药用菌等为主要研究对象，针对正在开发利用和具有开发利用前景的高山经济植物开展种质资源收集、评价、遗传育种研究及配套栽培技术研究、加工技术研究，开展高山野生珍稀濒危植物资源保护与利用研究。
农科院高山所拥有科技试验示范基地，积极开展新品种、新技术的示范推广及相关科技培训，抓好科技成果的转化应用，促进了高寒地区种植业结构调整优化和提质增效，促进了农民增收。同时，高山所自身的科技创新能力、公共服务能力和综合实力也得到了不断提升。