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军事医学科学院是中国人民解放军的最高医学研机构，下设卫生勤务与医学情报研究所、放射与辐射医学研究所、基础医学研究所、卫生学环境医学研究所、微生物流行病研究所、毒物药物研究所、卫生装备研究所、生物工程等研究所、野战输血研究所、军事兽医研究所等11个研究机构，以及307医院、解放军医学图书馆、实验仪器厂、实验动物中心、研究生队等附属机构，驻地分布于北京、天津、吉林、黑龙江四省市。
军事医学科学院主要承担军事医学、基础医学、生物技术、卫生装备和药物研究任务，肩负军事斗争卫勤准备、反恐防恐卫勤准备和疾病防控卫勤准备使命，已建立了以44个国家、军队重点实验室和研究中心为支撑的科学研究体系，以理、工、农、医、管、军6大学科门类24个博士学位授权点、31个硕士学位授权点为依托的人才培养体系，形成了平战结合、军民兼容、以军为主、寓军于民的科学研究格局。