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陕西高速公路收费中心是陕西省交通运输厅直属处级事业单位，其前身为成立于2002年的陕西省交通厅收费公路管理中心，主要负责收费站（点）设立、调整、撤消、延期、调整收费标准的初审、申报工作和收费还贷公路通行费收支预决算审查和会计核算、清算。同时还负责联网高速公路通行费收入资金的归集、清分及会计核算，以及通行费收费票据（卡）的管理，组织收费稽查工作。
陕西高速公路收费中心目前下设办公室、收费管理科、监控管理科、财务管理科、联网结算科、工程技术科、审计监察科（稽查科）、陕北分中心、基建办、陕西高速公路电子收费有限公司、综合管理部、客户服务部等机构。