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北京医药行业协会是由北京市工业促进局管理的以北京地区医药、医疗器械、工商企业、科研、大专院校相关企业为会员，依照国家有关法律法规自愿组成的自律性、非营利性的社会团体，也是企业与政府之间的桥梁和纽带，以及北京医药经济生活中的重要力量。现有会员二百余家，覆盖了北京医药行业主要的大中型工商企业。
北京医药行业协会按照建立社会主义市场经济体制的要求，加快改革调整和规范发展。并在实践中，积极探索适应社会主义市场经济要求的组织形式和工作方式，并在政府转变职能后，存在于政府与企业之间的桥梁与纽带，协助政府逐步实现从直接管理转向间接管理，旨在通过协助政府实施行业管理和维护企业合法权益，推动北京医药行业和企业的健康发展。