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食品药品审核查验中心是直属于国家食品药品监督管理总局的事业单位，也是国家食品药品监督管理总局重要的技术支撑机构之一，内设办公室、质量管理处、研究核查处、药品化妆品核查处、医疗器械核查处、国际核查处等机构。
食品药品审核查验中心主要组织制定药品、医疗器械、化妆品审核查验工作的技术规范和管理制度；参与制定药品、医疗器械、化妆品相关质量管理规范及指导原则等技术文件；组织开展药品注册现场核查相关工作。开展药物研究、药品生产质量管理规范相关的合规性核查和有因核查；开展医疗器械相关质量管理规范的合规性核查、临床试验项目现场核查以及有因核查；组织开展药品、医疗器械、化妆品质量管理规范相关的飞行检查；承担相关国家核查员的聘任、考核、培训等日常管理工作，指导地方核查员队伍建设；指导地方药品、医疗器械、化妆品审核查验相关工作，开展审核查验机构能力评价相关工作；负责汇总分析全国药品审核查验相关信息，开展相关风险评估工作；开展药品、医疗器械、化妆品审核查验相关的理论、技术和发展趋势研究；组织开展相关审核查验工作的学术交流和技术咨询；组织开展药品、医疗器械、化妆品相关境外核查工作；承担审核查验相关的国际交流与合作工作。