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上海医药商业协会是由本市药品流通行业及相关领域内的企事业单位自愿结成的全市性、行业性、非营利性社会组织，也是由上海市商务委员会主管的国内首批5A级行业组织，旨在遵照国家的法律、法规、规章和政策，遵守社会道德风尚，发挥桥梁纽带作用，服务企业、行业、政府、社会，反映企业合理诉求，维护企业合法权益，加强行业自律，协助政府做好引领行业发展、实施行业管理工作，履行社会责任，满足人民防病、治病、保健的需要，推进行业健康、快速、持续发展。
上海医药商业协会现有团体会员3100多家，内设价格、零售连锁、医药物流、医疗器械、化学试剂玻璃仪器五个专业委员会、五个职能部门和一个行业培训中心，具有行业管理、药品价格、质量管理、行业统计、行业培训、信息交流、经济咨询七大专业功能。