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广东疾病预防控制中心是隶属于广东省卫生和计划生育委员会的全省突发公共卫生事件应急处置和疾病预防控制技术指导中心，主要负责全省疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导。
广东疾病预防控制中心共设传染病预防控制所、艾滋病预防控制所、寄生虫病预防控制所、消毒与病媒生物预防控制所、免疫所、慢性非传染性疾病预防控制所、基层卫生与地方病预防控制所、营养与食品安全所、环境与学校卫生所、病原微生物检验所、卫生化验所 卫生毒理所、办公室、纪检监察室（与党委办公室合署）、人力资源部、计划财务部、科教与信息部、公共卫生应急部、生物制品与器械部、质量技术部等20个副处级内设部门和2个正处级直属机构——广东省公共卫生研究院和广东省生物制品与药物研究所。