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中国卫生信息学会是国家卫生和计划生育委员会主管，由从事卫生信息工作和与其相关工作的单位和个人自愿结成的从事卫生信息科学与技术研究的专业性、非营利性、全国性的社会组织，以中国特色社会主义理论体系为指导，遵守宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会道德风尚，联合全体会员，进行卫生信息理论与应用技术的学术研究，开展卫生信息科技宣传与普及工作，作为联系政府、卫生机构和信息技术厂商的桥梁，为促进卫生信息化发展，提高国民健康水平和国家卫生事业现代化管理服务。
中国卫生信息学会现有卫生信息标准专业委员会、公共卫生信息专业委员会、妇幼保健信息专业委员会、医院统计专业委员会、卫生管理统计专业委员会、健康统计专业委员会、统计理论与方法专业委员会、健康档案与区域卫生信息化专业委员会、电子病历与医院信息化专业委员会、健康卡应用与管理专业委员会、卫生信息安全与新技术应用专业委员会、中医药信息化专业委员会、卫生统计学教育专业委员会、卫生信息学教育专业委员会、军队卫生信息专业委员会、卫生地理信息专业委员会、远程医疗信息化专业委员会17个专业委员会。